Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bcl11bQ99PV8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bcl11bQ99PV8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms