Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd3Q99PL7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms