Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Atp1b4Q99ME6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp1b4Q99ME6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp1b4Q99ME6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms