Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Nus1Q99LJ8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nus1Q99LJ8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nus1Q99LJ8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms