Protein–RNA interactions for Protein: Q99LC5

Etfa, Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EtfaQ99LC5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EtfaQ99LC5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EtfaQ99LC5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EtfaQ99LC5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EtfaQ99LC5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EtfaQ99LC5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EtfaQ99LC5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EtfaQ99LC5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EtfaQ99LC5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EtfaQ99LC5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EtfaQ99LC5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EtfaQ99LC5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EtfaQ99LC5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EtfaQ99LC5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EtfaQ99LC5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EtfaQ99LC5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EtfaQ99LC5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EtfaQ99LC5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EtfaQ99LC5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EtfaQ99LC5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EtfaQ99LC5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EtfaQ99LC5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EtfaQ99LC5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EtfaQ99LC5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EtfaQ99LC5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EtfaQ99LC5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EtfaQ99LC5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EtfaQ99LC5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EtfaQ99LC5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EtfaQ99LC5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EtfaQ99LC5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EtfaQ99LC5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EtfaQ99LC5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EtfaQ99LC5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EtfaQ99LC5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EtfaQ99LC5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EtfaQ99LC5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EtfaQ99LC5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms