Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms