Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PpifQ99KR7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms