Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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TrabdQ99JY4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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TrabdQ99JY4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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TrabdQ99JY4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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TrabdQ99JY4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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TrabdQ99JY4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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TrabdQ99JY4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TrabdQ99JY4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TrabdQ99JY4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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