Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apobec3Q99J72 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms