Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Rnf144aQ925F3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Rnf144aQ925F3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Rnf144aQ925F3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Rnf144aQ925F3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Rnf144aQ925F3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Rnf144aQ925F3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Rnf144aQ925F3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Rnf144aQ925F3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Rnf144aQ925F3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Rnf144aQ925F3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Rnf144aQ925F3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Rnf144aQ925F3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Rnf144aQ925F3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf144aQ925F3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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