Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim59Q922Y2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms