Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Odf3Q920N1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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