Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarca5Q91ZW3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smarca5Q91ZW3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms