Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Pde6cQ91ZQ1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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Pde6cQ91ZQ1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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Pde6cQ91ZQ1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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Pde6cQ91ZQ1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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Pde6cQ91ZQ1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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Pde6cQ91ZQ1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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Pde6cQ91ZQ1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde6cQ91ZQ1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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