Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y12

Pcdha8, Protocadherin alpha 8, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha8Q91Y12 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcdha8Q91Y12 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms