Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd3Q91W18 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms