Protein–RNA interactions for Protein: Q91V80

Apof, Apolipoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApofQ91V80 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms