Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ubxn4Q8VCH8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms