Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg10Q8R1P4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg10Q8R1P4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms