Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CipcQ8R0W1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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