Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0K9

E2f4, Transcription factor E2F4, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f4Q8R0K9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2f4Q8R0K9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2f4Q8R0K9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2f4Q8R0K9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2f4Q8R0K9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2f4Q8R0K9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2f4Q8R0K9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2f4Q8R0K9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2f4Q8R0K9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f4Q8R0K9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f4Q8R0K9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f4Q8R0K9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f4Q8R0K9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f4Q8R0K9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f4Q8R0K9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f4Q8R0K9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f4Q8R0K9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f4Q8R0K9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f4Q8R0K9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f4Q8R0K9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f4Q8R0K9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f4Q8R0K9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f4Q8R0K9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f4Q8R0K9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2f4Q8R0K9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f4Q8R0K9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f4Q8R0K9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f4Q8R0K9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f4Q8R0K9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f4Q8R0K9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f4Q8R0K9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f4Q8R0K9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f4Q8R0K9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f4Q8R0K9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f4Q8R0K9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f4Q8R0K9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f4Q8R0K9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f4Q8R0K9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f4Q8R0K9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f4Q8R0K9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f4Q8R0K9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f4Q8R0K9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f4Q8R0K9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f4Q8R0K9 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2f4Q8R0K9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f4Q8R0K9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms