Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZT2

Ccsap, Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsapQ8QZT2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CcsapQ8QZT2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms