Protein–RNA interactions for Protein: Q8K424

Trpv3, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 3, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv3Q8K424 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpv3Q8K424 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpv3Q8K424 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms