Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcf3Q8K268 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms