Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nek9Q8K1R7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nek9Q8K1R7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nek9Q8K1R7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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