Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms