Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CopaQ8CIE6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CopaQ8CIE6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms