Protein–RNA interactions for Protein: Q8CG50

Rab43, Ras-related protein Rab-43, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab43Q8CG50 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rab43Q8CG50 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rab43Q8CG50 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rab43Q8CG50 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rab43Q8CG50 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rab43Q8CG50 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rab43Q8CG50 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rab43Q8CG50 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rab43Q8CG50 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rab43Q8CG50 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rab43Q8CG50 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab43Q8CG50 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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