Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms