Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc63Q8CDV6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms