Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms