Protein–RNA interactions for Protein: Q8C263

Ska3, Spindle and kinetochore-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska3Q8C263 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ska3Q8C263 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms