Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Tnfsfm13Q8BXS2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Tnfsfm13Q8BXS2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Tnfsfm13Q8BXS2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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