Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN3

Catsper4, Cation channel sperm-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper4Q8BVN3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Catsper4Q8BVN3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Catsper4Q8BVN3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Catsper4Q8BVN3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Catsper4Q8BVN3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Catsper4Q8BVN3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Catsper4Q8BVN3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Catsper4Q8BVN3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Catsper4Q8BVN3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Catsper4Q8BVN3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Catsper4Q8BVN3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Catsper4Q8BVN3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Catsper4Q8BVN3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Catsper4Q8BVN3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Catsper4Q8BVN3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Catsper4Q8BVN3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Catsper4Q8BVN3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Catsper4Q8BVN3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Catsper4Q8BVN3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Catsper4Q8BVN3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Catsper4Q8BVN3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Catsper4Q8BVN3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Catsper4Q8BVN3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Catsper4Q8BVN3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Catsper4Q8BVN3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Catsper4Q8BVN3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Catsper4Q8BVN3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Catsper4Q8BVN3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Catsper4Q8BVN3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Catsper4Q8BVN3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms