Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT14

Cnot4, CCR4-NOT transcription complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot4Q8BT14 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnot4Q8BT14 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot4Q8BT14 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot4Q8BT14 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot4Q8BT14 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot4Q8BT14 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot4Q8BT14 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot4Q8BT14 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot4Q8BT14 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms