Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pbrm1Q8BSQ9 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pbrm1Q8BSQ9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pbrm1Q8BSQ9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pbrm1Q8BSQ9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pbrm1Q8BSQ9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pbrm1Q8BSQ9 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pbrm1Q8BSQ9 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Pbrm1Q8BSQ9 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pbrm1Q8BSQ9 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pbrm1Q8BSQ9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pbrm1Q8BSQ9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pbrm1Q8BSQ9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms