Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI4

Gen1, Flap endonuclease GEN homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gen1Q8BMI4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms