Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gga3Q8BMI3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gga3Q8BMI3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms