Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Usp54Q8BL06 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp54Q8BL06 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms