Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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Cpped1Q8BFS6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Cpped1Q8BFS6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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