Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZF2

Ifne, Interferon epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfneQ80ZF2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IfneQ80ZF2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms