Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSV6

Got1l1, Putative aspartate aminotransferase, cytoplasmic 2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Got1l1Q7TSV6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Got1l1Q7TSV6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Got1l1Q7TSV6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Got1l1Q7TSV6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Got1l1Q7TSV6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Got1l1Q7TSV6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Got1l1Q7TSV6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Got1l1Q7TSV6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Got1l1Q7TSV6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Got1l1Q7TSV6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Got1l1Q7TSV6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Got1l1Q7TSV6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Got1l1Q7TSV6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Got1l1Q7TSV6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Got1l1Q7TSV6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Got1l1Q7TSV6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Got1l1Q7TSV6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Got1l1Q7TSV6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Got1l1Q7TSV6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Got1l1Q7TSV6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Got1l1Q7TSV6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Got1l1Q7TSV6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Got1l1Q7TSV6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms