Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lamp3Q7TST5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lamp3Q7TST5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms