Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh8Q7TSK3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms