Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actn1Q7TPR4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms