Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Prrc2bQ7TPM1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prrc2bQ7TPM1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms