Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Uhrf2Q7TMI3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Uhrf2Q7TMI3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Uhrf2Q7TMI3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Uhrf2Q7TMI3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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