Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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