Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Topbp1Q6ZQF0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms