Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms